| Chương I: Một cha dòng Tên ở Việt Nam tới Rôma | 5 | 
| I. Cha Đắc Lộ trên đường đi công cán | 5 | 
| II. Quyền bảo trợ của người Bồ Đào Nha, một trở ngại cho cuộc vận động của cha ĐL | 9 | 
| III. Sứ mệnh và hoạt động của Bộ Truyền giáo | 14 | 
| IV. Cuộc vận động của cha Đắc Lộ với Bộ Truyền giáo | 20 | 
| Chương II: Hai Giám mục tiên khởi của Giáo Hội Việt Nam | 27 | 
| I. Quyết định thành lập hai Toà Giám Mục đại diện Toà Thánh ở Việt Nam | 27 | 
| II. Các Đức Giám Mục sửa soạn lên đường đến địa sở truyền giáo | 35 | 
| Chương III: Hai Đức Giám Mục ở kinh đô Thái Lan | 45 | 
| I. Đức cha Lambert de la Motte và những khó khăn với ngưởi Bồ Đào Nha ở Thái Lan | 45 | 
| II. Các Đức Giám Mục quyết định thành lập trụ sở ở kinh đô Thái Lan | 54 | 
| Chương IV: Các đức Giám Mục và thừa sai Hội Truyền Giáo Balê kêu gọi Toà Thánh Rôma | 67 | 
| I. Kêu gọi lần I, cha Giacôbê de Bourges qua Rôma (1664-1665) | 69 | 
| II. Kêu gọi lần II, Đức Cha Phanxicô Pallu qua Rôma (1667-1669) | 81 | 
| Chương V: Hai cha chính Luigi Chevreul và Anton Hainques ở địa phận Đàng trong | 93 | 
| I. Cha chính Luigi Chevreul, đại diện đầu tiên của Đức Cha Lambert ở Đàng trong | 93 | 
| II. Cha chính Anton Hainques, đại diện thứ hai của ĐC Lambert ở Đàng trong | 103 | 
| Chương VI: Cha chính Phanxicô Deydier với tổ chức Thầy giảng và việc thành lập … | 115 | 
| I. Cha chính Phanxicô và những tiếp xúc đầu tiên với giáo dân và Thầy giảng Đ. Ngoài | 115 | 
| II. Chính Phanxicô Deydier với tổ chức Thầy  giảng và thành lập Giáo sĩ bản quốc | 129 | 
| Chương VII: Hoạt động truyền giáo của cha Phanxicô Deydier ở Đàng ngoài | 141 | 
| I. Hoạt động truyền giáo của cha Phanxicô với các Thầy giảng và 2 Lm đàng ngoài | 141 | 
| II. Các thừa sai dòng Tên trở lại địa phận Đàng ngoài (1669) | 150 | 
| Chương VIII: Đức cha Lambert kinh lược địa phận Đàng ngoài (1669-1670) | 159 | 
| I. Lễ truyền chức đầu tiên trên đất nước VN và Công đồng I địa phận đàng ngoài | 159 | 
| II. Thành lập dòng Mến Thánh Giá đầu tiên ở VN | 168 | 
| Chương IX: Đức cha Lambert kinh lược địa phận Đàng trong lần I | 177 | 
| I. Ở kinh đô Thái Lan, sau cuộc kinh lược địa phận Đàng ngoài | 177 | 
| II. Đức cha Lambert kinh lược địa phận Đàng trong lần I | 183 | 
| III. Hoạt động của các thừa sai Pháp và linh mục VN ở địa phận Đ. Trong | 193 | 
| Chương X: Hoạt động của Đức cha Lambert ở  kinh đô Thái Lan và cuộc kinh lược… | 203 | 
| I. Hoạt động của Đức cha Lambert ở kinh đô Thái Lan | 203 | 
| II. Cuộc kinh lược lần II ở địa phận đàng trong của Đức cha Lambert | 215 | 
| Chương IX: Những thử thách của hai cha Deydier và Giacôbê de Bourges ở Đàng ngoài | 227 | 
| I. Cha Deydier bị bắt giam (1670-1672), giáo dân bị bách hại | 227 | 
| II. Hoạt động truyền giáo của các linh mục VN ở đàng ngoài, vấn đề huấn luyện | 234 | 
| III. Các cha dòng Tên đối với Quyền bính. Tình trạng chia rẽ ở đàng ngoài (1670-1675) | 241 | 
| Chương XII: Hoà bình và trật tự được phục hồi (1673-1677) | 253 | 
| I. Các ĐGM và Thừa sai hội Truyền giáo Balê kêu gọi về Toà Thánh lần III | 253 | 
| II. Hoà bình và trật tự được phục hồi (1676-1677) | 267 | 
| Chương XIII: Các cha dòng Đaminh tới xứ Bắc, tình hình Đàng ngoài và Đàng trong | 277 | 
| I. Các cha dòng Đaminh tới xứ Bắc (1676-1680) | 277 | 
| II. Tình hình địa phận Đàng ngoài và Đàng trong (1676-1680) | 287 |